O outrora próspero Planeta Bio é destruído após o início de uma guerra mundial pelo uso de uma descoberta científica chamada "Bio Particles". A Aliança para Manutenção da Paz Planet Bio que procurou usar Bio Particles para fins pacíficos, envia o robô gigante Bio Robo e um robô assistente chamado Peebo para impedir que a mesma tragédia aconteça na Terra. O Bio Robo chega ao Japão do século XV, onde mostra Bio Particles em cinco jovens. Cinco séculos depois, os descendentes desses indivíduos, infundidos com Bio Particles, são escolhidos por Peebo e Bio Robo para se tornar a equipe Bioman para proteger a Terra do Neo-Empire Gear, uma organização liderada pelo cientista louco Doctor Man.